核酸样品降解检测

点击:90丨发布时间:2025-08-19 10:41:24丨关键词:CMA/CNAS/ISO资质,中析研究所,核酸样品降解检测

上一篇:铝合板隔热性能测试丨下一篇:安全网耐磨性测试

参考周期:常规试验7-15工作日,加急试验5个工作日。

因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外)。

CMA/CNAS等证书详情,因时间等不可抗拒因素会发生变更,请咨询在线工程师。

检测项目

分子完整性检测:

  • 片段大小分布:平均长度(bp范围100-10000)、峰值比例(≥60%,参照ISO20395:2019)
  • 降解指数:DI值计算(DI≥1.5表示降解)
  • 完整性评分:RIN值(RNA完整性数≥7.0)
浓度与纯度测定:
  • DNA浓度:ng/μL(精度±5%,参照GB/T37864-2019)
  • RNA纯度:A260/A280比值(1.8-2.0)
  • 污染物检测:A260/A230比值(≥1.8)
荧光定量分析:
  • Qubit测定:荧光强度(范围0.1-1000ng)
  • SYBRGreen染色:降解阈值(≤20%片段损失)
  • 降解产物检测:荧光信号偏移(波长偏差±5nm)
电泳评估:
  • 琼脂糖凝胶电泳:片段迁移率(分辨率1-50kb)
  • 毛细管电泳:片段分辨率(≥1bp)
  • 迁移距离:标准分子量标记匹配度(偏差≤5%)
PCR适用性测试:
  • 扩增效率:Ct值差异(ΔCt≤2)
  • 产物大小:PCR片段长度(预期范围±10bp)
  • 假阴性率:降解样本检出限(≤5%)
RNA特定检测:
  • 28S/18S比值:≥1.8
  • rRNA完整性:降解率计算(%/hour)
  • 热敏感性:70°C降解速率(≤10%/min)
核酸酶污染检测:
  • RNase活性:活性单位(≤0.001U/mL)
  • DNase残留:阴性对照要求(无扩增)
  • 酶抑制测试:抑制剂浓度(≤0.1μg/mL)
温度稳定性:
  • 热降解实验:降解率(%/minat70°C)
  • 冻融循环:完整性变化(≤5%degradation)
  • 室温暴露:稳定性时限(≤1小时)
储存性能评估:
  • 长期储存:降解速率(%/monthat-80°C)
  • 短期保存:冷藏稳定性(≤48小时)
  • 冻干样品:复水后完整性(≥95%)
降解产物分析:
  • 寡核苷酸片段:长度分布(<200bp)
  • 碱基损伤:氧化损伤率(≤1%)
  • 末端完整性:5'端磷酸化水平(≥90%)

检测范围

1.临床血液样品:侧重DNA提取后降解评估,防止PCR假阴性,重点检测冻融循环影响和RNase污染。

2.组织活检样品:涵盖福尔马林固定石蜡包埋组织,检测重点为片段大小分布和A260/A280比值偏差。

3.细胞培养样品:针对悬浮或贴壁细胞,评估RNA完整性数(RIN)和热降解速率,确保qPCR可靠性。

4.环境微生物样品:包括土壤或水体核酸,侧重污染物水平和降解指数,防止扩增失败。

5.法医样品:涉及陈旧血痕或毛发,检测重点为低浓度DNA的片段大小分布和假阴性风险评估。

6.古DNA样品:涵盖化石或考古样本,评估降解产物和碱基损伤,优化测序适配性。

7.植物组织样品:针对叶片或根系,检测多糖污染和片段迁移率,确保文库构建质量。

8.病毒RNA样品:包括流感或冠状病毒,侧重RNase活性和冻融完整性变化,保障诊断准确性。

9.细菌基因组DNA:涉及革兰氏阳性菌,评估浓度精度和PCR扩增效率,防止梯度稀释误差。

10.合成核酸样品:涵盖寡核苷酸或引物,检测末端完整性和降解阈值,优化克隆实验。

检测方法

国际标准:

  • ISO20395:2019核酸降解检测方法(采用毛细管电泳分辨率≥1bp)
  • ASTME3135-18RNA完整性评估指南(聚焦RIN值计算)
  • ISO17025:2017测试与校准实验室能力(涵盖精度控制)
国家标准:
  • GB/T37864-2019DNA降解检测方法(偏好凝胶电泳迁移率分析)
  • GB/T34798-2017核酸纯度光谱检测(UV吸光度A260精度±0.01)
  • GB/T30988-2014RNA提取与检测(强调28S/18S比值)
方法差异说明:ISO标准优先使用毛细管电泳实现高分辨率(≥1bp),而GB标准常采用凝胶电泳成本较低但分辨率稍低(1-50kb);ASTM指南侧重RNA完整性,GB标准则整合DNA/RNA统一参数。

检测设备

1.凝胶电泳系统:Bio-RadGelDocXR+(分辨率1-50kb)

2.毛细管电泳仪:Agilent2100Bioanalyzer(片段分辨率≥1bp)

3.荧光定量仪:ThermoFisherQubit4.0(检测范围0.1-1000ng)

4.分光光度计:NanoDropOne(波长范围190-840nm)

5.PCR仪器:AppliedBiosystems7500(温控精度±0.1°C)

6.离心机:Eppendorf5425R(转速范围100-15000rpm)

7.生物分析仪:AgilentTapeStation(自动化片段分析)

8.微量天平:SartoriusCubis(精度0.001mg)

9.核酸提取仪:QiagenQIAcube(通量96样本/小时)

10.冷冻柜:ThermoScientificJianCeT(温度范围-86°C)

11.热循环仪:Bio-RadT100(升温速率4°C/s)

12.荧光显微镜:OlympusIX83(激发波长488nm)

13.恒温水浴锅:MemmertWNB14(温度稳定性±0.1°C)

14.振荡器:IKAMS3(转速50-1500rpm)

15.紫外透射仪:VilberLourmatTFX-20M(波长302nm)

北京中科光析科学技术研究所【简称:中析研究所】

报告:可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期:7~15工作日,可加急。

资质:旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试:严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试:支持定制化试验方案。

售后:报告终身可查,工程师1v1服务。